kognitywistyka.net: forum
Umysł - Mózg - Sztuczna Inteligencja

Neuronauki - Modelowanie neuronów i biologicznych sieci neuronalnych

Marcin Ciesielski - 2006-11-11, 11:11
Temat postu: Modelowanie neuronów i biologicznych sieci neuronalnych
Jakie oprogramowanie (spośród dostępnego bezpłatnie) do modelowania neuronów i biologicznych sieci neuronalnych uważacie za najlepsze? Do symulowania sieci niektórzy polecają Genesis ( http://www.genesis-sim.org/GENESIS/ ). Czy uważacie, że to dobry wybór?

Jeśli chodzi o środowiska do symulacji pojedynczych neuronów, według popularnego podręcznika pod red. Arbiba jest ich sporo (chociaż poniższa lista zawiera także narzędzia do symulowania sieci):

BioPSE http://www.sci.utah.edu/ncrr/software/biopse.html
BIOSIM ftp://ftp.uni-kl.de/pub/bio/neurobio/
CATACOMB http://www.compneuro.org/catacomb/index.shtml
CONICAL http://www.strout.net/conical/
GENESIS http://www.genesis-sim.org/GENESIS/
Maxsim http://ibcmsg6.unil.ch/staff/tettoni/maxsim/
Mcell http://www.mcell.cnl.salk.edu/
NeMoSys http://cns.montana.edu/research/nemosys
NEST/SYNOD http://www.synod.uni-freiburg.de/
NEURON http://www.neuron.yale.edu/
NeuronC http://retina.anatomy.upenn.edu/rob/neuronc.html
Nodus http://bbf-www.uia.ac.be/SOFT/downloads.shtml
NSL http://www-hbp.usc.edu/Projects/nsl.htm
Neurosys http://nexus.cs.usfca.edu/neurosys/
SEE http://debian.nada.kth.se/sans.php?conttools
SNNAP http://snnap.uth.tmc.edu/
SONN http://www.Is.[-].ac.il/litvak/Sonn/sonn.html
SpikeNET http://www.cnl.salk.edu/arno/SpikeNET
Surf-Hippo http://www.cnrs-gif.fr/iaf/iaf9/surf-hippo.html
XNBC http://www.u444.jussieu.fr/xnbc/
BIOQ http://www.Is.[-].ac.il/litvak/Bioq/bioq.html
CKS http://www.almaden.ibm.com/st/msim/index.html
DBSolve http://websites.ntl.com/igor.goryanin/
Gepasi http://www.gepasi.org/
Jarnac/Indigo http://www.sys-bio.org
KinSim/FitSim http://www.biochem.wustl.edu/cflab/message.html
MacKinetics http://members.dca.net/leipold/mk/advert.html
MetaModel http://bip.cnrs-mrs.fr/bip10/modeling.htm
StochSim http://www.zoo.cam.ac.uk/comp-cell/StochSim.html
Vcell http://www.nrcam.uchc.edu/index.html

Które z tych programów uważacie za godne uwagi? Jaką wiedzę mtematyczną należy posiadać, żeby sprawnie korzystać z takiego oprogramowania? Oczywiste jest, że w znacznym stopniu trzeba znać równania różniczkowe, tzreba też doskonale znać statystykę, ale to jest oczywiste - poza tym co jeszcze? Czy ktoś z Was miał doświadczenia z modelowanie komputerowym?

Krzysztof Gorgolewski - 2007-02-28, 17:57

I jak testowanie? Jakie masz doświadczenia? Opinie?

Powered by phpBB modified by Przemo © 2003 phpBB Group